Genoom visualisatie

Het visualiseren van multi-disciplinaire data afkomstig van experimenten op cultivars behoort tot de mogelijkheden bij Genetwister.

Zo is het mogelijk een gecombineerde weergave van NGS data en micro-array gen expressie data te visualiseren om onderzoekers bijvoorbeeld in één oogopslag te tonen welke voorspelde genen (uit onze ORF predictie workflow) tot expressie komen in de lijnen van de klant met daarbij de unieke SNPs in elke lijn.

De kwaliteit van de assembly uitgevoerd bij Genetwister kan worden bekeken door visualisatie van coverage op een publiekelijk beschikbaar referentie genoom. Klanten krijgen de mogelijkheid om via een webinterface te zoeken in de genomische data van hun cultivars en krijgen deze op een overzichtelijke en snelle manier gepresenteerd.

terug