SNP discovery and detection

SNPs worden geïdentificeerd door onze ontwikkelde SNPaware software™ te gebruiken in combinatie met sequentie data van het genoom of het transcriptoom. Dit maakt snelle detectie van SNPs in specifieke regio’s van het genoom mogelijk, bijvoorbeeld rond loci die tot expressie komen. Hierdoor kan een directe link met phenotypische eigenschappen worden gelegd. Toegang tot genetische kaarten met moleculaire merkers is direct mogelijk door koppeling met gebruiksvriendelijke databases en genoom browsers.

Na SNP discovery kan SNP genotypering gedaan worden op grote aantallen (veredelde) lijnen om de mate van genetische variatie tussen deze lijnen te bepalen. Verscheidene SNP genotypering methodes zijn ontwikkeld ofwel commercieel beschikbaar en de meest geschikte methode wordt gekozen op basis van het aantal SNPs en individuen die getypeerd moeten worden. De SNPs worden dan opgeslagen in databases zodat de klant deze kan gebruiken in merker-gestuurde veredelingsprogramma’s.

terug